Структурно-функціональні основи міжмолекулярної взаємодії каликс[4]-арену С-97 із субфрагментом-1 міозина міометрія [] / Р. Д. Лабинцева [та ін.] // Укр. біохім. журнал. - 2012. - Том 84, N 1. - С. 34-44 Рубрики: ГЛАДКОЙ МЫШЦЫ МИОЗИНЫ--SMOOTH MUSCLE MYOSINS МАКРОЦИКЛИЧЕСКИЕ СОЕДИНЕНИЯ--MACROCYCLIC COMPOUNDS Анотація: Каликс[4]арен С-97 (указан шифр) – макроциклическое соединение, имеющее внутримолекулярную высокоупорядоченную липофильную полость, образованную четырьмя ароматическими кольцами, одно из них по верхнему ободу функционализировано метиленбисфосфоновой группой. Показано, что это соединение в концентрации 100 мкМ эффективно ингибирует АТР-азную активность субфрагмента-1 миозина миометрия свиньи; коэффициент ингибирования І0,5 составляет 83 ± 7 мкМ. Вместе с тем, указанный каликс[4]арен вызывает достоверное по отношению к контролю увеличение эффективного гидродинамического диаметра субфрагмента-1 миозина, что может свидетельствовать о межмолекулярном комплексообразовании между каликс[4]ареном и головкой миозина. С использованием методов компьютерного моделирования (докинг, молекулярная динамика с привлечением грид-технологий) выяснены структурные основы межмолекулярного взаимодействия каликс[4]арена С-97 с субфрагментом-1 миозина миометрия, участие гидрофобных, электростатических и ?-? (стэкинг) взаимодействий между каликсареном С-97 и аминокислотными остатками субфрагмента-1 миозина; некоторые из них находятся рядом с активным центром АТР-азы. Калікс[4]арен С-97 (зазначено шифр) - це макроциклічна сполука, що має внутрішньомолекулярну високовпорядковану ліпофільну порожнину, утворену чотирма ароматичними кільцями, одне з яких по верхньому вінцю функціоналізовано метиленбісфосфоновою групою. Показано, що ця сполука у концентрації 100 мкМ ефективно інгібує АТР-азну активність субфрагмента-1 міозину міометрія свині; коефіцієнт інгібування І0,5 становить 83 ± 7 мкМ. Водночас, зазначений калікс[4]арен спричинює вірогідне стосовно контролю збільшення ефективного гідродинамічного діаметра субфрагмента-1 міозину, що може свідчити про міжмолекулярне комплексоутворення між каліксареном та голівкою міозину. Із використанням методів комп’ютерного моделювання (докінг, молекулярна динаміка із залученням грід-технологій) з’ясовані структурні основи міжмолекулярної взаємодії калікс[4]арену С-97 із субфрагментом-1 міозину міометрія та участь гідрофобних, електростатичних та ?-? (стекінг) взаємодій між каліксареном і амінокислотними залишками субфрагмента-1 міозину, окремі з яких розташовані поряд з активним центром АТР-ази. Дод.точки доступу: Лабинцева, Р. Д.; Бевза, А. А.; Бевза, О. В.; Черенок, С. О.; Кальченко, В. І.; Костерін, С. О. Экз-ры: |