Хрусталев, В. В.
    Мутационное давление в геномах альфагерпесвирусов, поражающих человека [] / В.В. Хрусталев, Е.В. Барковский // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2008. - N2. - С. 37-41.
Аннотация: Геномы вирусов простого герпеса (ВПГ1 и ВПГ2) являются высоко GC-насыщенными (уровень G+С в них равен соответственно 0,68 и 0,70), что говорит о подверженности их сильному мутационному GС-давлению. Геном варицелла зостер вируса (ВЗВ) имеет уровень GС-насыщенности 0,46, что говорит о подверженности его слабому АТ-давлению. Нами были рассчитаны частоты нуклеотидных замен по направлению мутационного давления для генов, кодирующих большой капсидный протеин (БКП) альфагерпесвирусов, поражающих человека. Для ВПГ1 частоты замен рассчитаны от гена БКП ВПГ1 (G+С = 0,68, 3GС = 0,89) к гену БКП ВПГ2 (G+С = 0,70, 3GС = 0,91) и к гомологичному гену (G+С = 0,73, 3GС = 0,99), филогенетически близкому к ВПГ обезьяньего герпесвируса 16. В этих двух парах генов среди всех замен преобладают трансверсии С G и G C, уступают им частоты транзиций по направлению мутационного GС-давления (Т C и A G), третьи по величине — частоты трансверсий А С и Т G. Для ВЗВ частоты замен были рассчитаны от гена БКП ВЗВ (G+С = 0,47, 3 GС = 0,41) к гену БКП (G+С = 0,41, 3 GС = 0,28) родственного ВЗВ обезьяньего герпесвируса 9. В этой паре генов преобладают транзиции по направлению мутационного АТ-давления (С Т и G А), несколько уступают им частоты трансверсий А Т и Т А, третьи по величине — частоты трансверсий С А и G Т. Для гена БКП ВЗВ вероятность возникновения транзиции, вызванной мутационным давлением, в третьих положениях кодонов (где абсолютное большинство транзиций синонимичны) в 2,36 раза выше, чем в гене БКП ВПГ1, и в 3 раза выше, чем в гене БКП ВПГ2. Эти данные могут служить объяснением редкого рецидивирования опоясывающего лишая по сравнению с герпетической инфекцией


Доп.точки доступа:
Барковский, Е.В.
Экз-ры: